예수 기도는 특별히 성 헤시키우스에 의하여 강조되었는데 “경성함과 거룩에 관해서”라는 글에서 성 헤시키우스는 자신이 1-2세기의 초대교부들의 글을 통해 영향을 받았다고 하면서 “우리는 지금까지 1-2세기에 작성된 글을 통해서 지성을 잠잠하게 만드는 어려운 기술을 배우는 방법을 제시해 왔습니다. 이 글들은 우리의 정신으로 이룩한 결과일 뿐만 아니라, 지성의 순결에 대해 우리를 가르치시는 거룩한 교부들의 작품이기도 합니다.”가로 합니다. 성 헤시키우스는 끊임없이 예수기도를 반복할 것을 강조하면서 말하기를, “- 즉, 주 예수 그리스도의 거룩한 이름이 우리를 위해서 중재하게 하기 위해서, 우리는 타는 마음으로 그리스도께 부탁해야 합니다. - 그리고 습관이 형성되면, 그것은 마치 천성인 듯이 우리를 다스립니다. 그러한 평정의 상태에 있는 지성은 숲속에서 토끼를 뒤쫓는 사냥개처럼 원수들을 추적해 찾아냅니다. 사냥개는 먹이를 얻기 위해서 추적하지만, 지성은 원수를 죽이기 위해서 추적합니다.”라고 합니다. 이 외에도 성 헤시키우스는 그의 글에서 최소한 9회 이상 예수 기도의 중요성을 강조하고 있다. 이 예수 기도의 형성은 대략 5세기에서 8세기 사이에 이루어졌는데 “예수여 이 죄인을 불쌍히 여기소서”(Jesus, Son of God, have mercy on me, a sinner)를 반복하는 것이다. 시편 51:1의 “하나님이여 주의 인자를 좇아 나를 긍휼히 여기시며 주의 많은 자비를 좋아 내 죄과를 도말하소서”(Have mercy on me, O Lord ...)와 시편 70:1의 “하나님이여 속히 나를 건지소서 여호와여 속히 나를 도우소서”(Hasten, O God, to save me; O Lord, come quickly to help me)와 그 내용이 유사합니다. 예수기도는 네 가지의 신학적 내용을 담고 있다.
 (4) 이 기도의 목적은 마음의 침묵(inner state of tranquility)과 정적(stillness of mind)에 이르는 것이다. 즉 이 기도를 통해 마음에 떠오르는 잡념들과 생각들을 극복하고 내면의 단순함과 고요에 이르는 것이다. 그 내면의 고요에서 기도자는 정신과 마음이 하나가 되어 하나님께존재의 중심으로부터 기도를 드리는 것이다. 
 (2) 죄에 대한 통회와 하나님의 자비를 간구하는 것으로 하나님 앞에서 자신의 죄를 비난하며 슬퍼하는 것이다. 칼리스토스 웨어(Kallistos Ware)는 예수 기도의 기원에 관한 연구에서 내적인 깊은 통회(penthos)라는 주제가 이미 성 안토니의 가르침에서 강조된 것임을 제시한다. 하나님은 통회하는 영혼을 위로하시고 그들에게 은혜를 베푸신다는 주제는 성서 전체에 흐르는 일관된 진리로 인간은 죄인이기에 하나님의 은혜가 필요한 존재라는 기독교 인간관을 잘 표현하고 있다.
 (3) 반복적인 기도를 통해 하나님의 임재를 일상에서 경험하는 훈련이다. 바로 식사나 노동, 쉼의 순간에도 이 기도를 반복함을 통해 매 순간 하나님의 임재를 경험하는 훈련이라고 할 수 있다. 이것은 바울이 말한 쉬지 말고 기도하라는 성서적 가르침을 실현하는 길이라고 할 수 있다. 실제로 이러한 실천을 통해